飞行时间质谱(MALDI-TOF)用于细菌鉴定
飞行时间质谱仪器主要由两部分组成:基质辅助激光解吸电离离子源(
和飞行时间质量分析器(TOF)。MALDI的原理是用激光照射样品与基质形成的共结晶薄膜,基质从激光中吸收能量传递给生物分子,而电离过程中将质子转移到生物分子或从生物分子得到质子,而使生物分子电离的过程。因此它是一种软电离技术,适用于混合物及生物大分子的测定。TOF的原理是离子在电场作用下加速飞过飞行管道,根据到达检测器的飞行时间不同而被检测即测定离子的质荷比(M/Z)与离子的飞行时间成正比,检测离子。
近年来,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(
已成为常规鉴定细菌和真菌的重要工具。这是一种快速且经济高效的方法,非常适合高通量应用,例如临床实验室中的病原体识别,食品行业的质量控制或培养物收集中的生物材料验证。
软件在导入和处理谱图数据方面提供了很大的灵活性。 支持来自不同硬件制造商(例如Bruker,Shimadzu,VITEK MS)的数据格式,并且可以将其导入同一数据库中。该软件使用预定义或自定义的处理模板
这些模板可轻松适应任何情况,并存储以备将来使用。
窗口中用例如基于相似度的聚类分析,主成分分析(PCA)或多维标度(MDS)。峰匹配可以滤除常见的背景峰并
于一组可区分的峰,从而大大提高了分析的灵敏度。矩阵挖掘工具对于识别潜在的生物标记非常有用。
细菌鉴定的市售参考数据库通常仅针对临床相关物种,并且附带有限的一组内置鉴定方法。利用BioNumerics软件,用户可以根据所选生物的质谱图建立自己的数据库,并将这些参考集存储为识别项目。然后可以基于完整谱图或自定义峰类别并使用复杂的分类器(例如Support Vector Machines和Naive Bayesian classifiers)进行未知分离物的鉴定。
专线:010-53639817 53639871
比利时Applied-Maths Bionumerics、比利时Bionumerics
生物信息分析软件、BioNumerics生物分析软件、BN分析软件、PFGE分析软件、Bionumerics软件7
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