GenesClouds微生物数据分析平台

北京中科助腾科技有限公司

分类:数据分析与溯源平台

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222 GenesClouds微生物全基因组数据存储分析平台,实现微生物全基因组数据的有序存储,提升实验室数据管理水平;提供“一键式”的生物信息学分析能力。

GenesClouds微生物全基因组数据存储分析平台,实现微生物全基因组数据的有序存储,提升实验室数据管理水平;提供“一键式”的生物信息学分析能力。

一、数据存储GenesClouds微生物数据分析平台基于分布式非冗余存储技术,实现全基因组测序数据及样本元数据的统一化管理与权限分组设置,形成一套微生物基因组测序原始数据管理体系,解决传统数据存储“易丢失”、“重复存”等问题,支持基于样品元信息标签字段的快速检索及样品分组视图的创建,实现微生物数据的安全有序存储。将传统的数据重复存储问题转为统一的数据管理,为查找数据节省时间。实现快速、专业、易用的高通量微生物数据处理分析,打破数据孤岛实现实验室之间的微生物数据互联互通。

二、数据分析平台整合基因组生物信息学分析功能,包括基因组数据的质控、拼接、cgMLST、wgSNP、基因组功能注释、耐药基因、毒力基因鉴定识别、血清型分析等,为微生物实验室及从业人员提供一个专业、高效、安全的数据存储与分析平台,为基于基因组学的多领域、跨时空的微生物精准溯源及耐药性、致病性、毒性等识别和预测分析提供科学数据支持,通过基于特征值的快速比对,实现近缘食源性致病菌的快速识别与筛选。基于分布式运算架构及弹性伸缩和消息队列技术,实现数据处理高效化、分析流程自动化、平台操作简单的高通量微生物数据处理分析平台 。

三、适用场景疾控中心、海关检疫、市场监管机构、农业系统、高校科研、医疗健康、食品企业、药品企业、第三方检验检测。

四、平台WGS分析功能质控拼接分析特征基因分析基因组注释(Prokka)菌种鉴定(Kraken2)分子分型(cgMLST/wgMLST/wgSNP)聚类分析GenesClouds微生物数据分析平台向用户提供以下菌种的wgMLST/cgMLST分析:

Acinetobacter baumannii Brucella melitensis Campylobacter jejuni/coli Clostridioides difficile Enterococcus faecalis Enterococcus faecium Escherichia coli Francisella tularensis Klebsiella pneumoniae/variicola/quasipneumoniae Legionella pneumophila Listeria monocytogenes Mycobacterium tuberculosis/bovis/africanum/canettii Mycoplasma gallisepticum Paenibacillus larvae Pseudomonas aeruginosa Salmonella enterica Staphylococcus aureus